Résumé

Fondation :

L’afflux continu d’informations provenant des arrangements de génomes et de la génomique utile a offert l’ascension vers un nouveau domaine de la bioinformatique, qui consolide les composantes de la science et du génie logiciel.

Objectifs :

Nous proposons ici une définition de ce nouveau domaine et vérifions une partie de l’exploration recherchée, notamment en ce qui concerne les cadres administratifs transcriptionnels.

Techniques :

Notre définition est la suivante : La bio-informatique consiste à conceptualiser la science jusqu’aux macromolécules (au sens de la science physique) et ensuite à appliquer des méthodes “informatiques” (obtenues à partir d’ordres, par exemple, de mathématiques appliquées, de génie logiciel et de mesures) pour comprendre et organiser les données liées à ces particules, à grande échelle.

RÉSULTATS ET CONCLUSIONS :

Les examens en bio-informatique se concentrent principalement sur trois types d’énormes ensembles de données accessibles en science atomique : les structures macromoléculaires, les arrangements du génome et les effets secondaires des tests pratiques de génomique (par exemple, les informations sur les articulations). Les données supplémentaires comprennent le contenu des articles logiques et des “informations sur les relations” provenant des voies métaboliques, des arbres de catégorisation scientifique et des systèmes d’association protéine-protéine. La bioinformatique utilise un large éventail de stratégies de calcul, notamment l’arrangement et l’agencement de base, le plan de la base de données et l’extraction d’informations, la géométrie macromoléculaire, le développement d’arbres phylogénétiques, la prévision de la structure et de la capacité des protéines, la recherche de qualité et le regroupement des informations d’articulation. L’accent est mis sur les méthodologies coordonnant un assortiment de techniques de calcul et de sources d’information hétérogènes. Enfin, la bioinformatique est une discipline terre à terre. Nous passons en revue certaines applications déléguées, par exemple la découverte d’homologues, la planification de médicaments et la réalisation de recensements à grande échelle. Des données supplémentaires appropriées à l’enquête sont accessibles sur le web à l’adresse http://bioinfo.mbb.yale.edu/what-is-it.